Моделирование эпидемического распространения генотипа belging mycobakterium в Республике Саха (Якутия)

Цель: реконструкция эпидемического распространения штаммов генотипа Beijing Mycobacterium tuberculosis на территории с ограниченными миграционными событиями на основе сравнительного изучения 153 изолятов, полученных от больных разных поколений из Республики Саха (Якутия). Материалы и методы. Путем MIRU-VNTR-генотипирования, субтипирования по участкам генома RD105/RD207, классификации паттернов по клональным комплексам Merker M. et al. (2015) и филогенетического моделирования была описана и проанализирована структура популяции Mycobacterium tuberculosis. Результаты. Показано, что высокотрансмиссивные субтипы генотипа Beijing, несущие высокий потенциал формирования антибиотикорезистентности, значимо чаще (χ2 = 8,3, p < 0,01) встречаются у молодых (после 1990 года рождения), чем в старшем поколении (до 1959 года рождения). Определен сдвиг в структуре популяции возбудителя, который произошел во время предыдущих пяти десятилетий. Заключение. Полученные данные подтверждают предположение более позднего заноса эпидемических субтипов генотипа Beijing (около пятидесяти лет назад) на территорию Республики Саха (Якутия) по сравнению с другими регионами России Goal: reconstruction of epidemic transmission of Beijing genotype of Mycobacterium tuberculosis on the territory with limited migration based on the comparative study of 153 isolates isolated from patients of different generations in the Sakha Republic (Yakutia). Materials and methods. The structure of Mycobacterium tuberculosis population was described and analyzed through